GitHub - całkowicie zepsuł lokalne pliki gitHub w moim komputerze

Stworzyłem repo w złym folderze. To znaczy folder użytkownika w systemie operacyjnym, gdzie wszystkie foldery użytkownika są od zdjęć, filmów do dokumentów. Więc pchnąłem to wszystko do gitHub bez wiedzy i teraz nie mogę już utworzyć repo, ponieważ pliki, z którymi pracuję, znajdują się w folderze dokumentów, który jest wewnątrz folderu użytkownika. I to będzie sugerować, że tworzę repo w ramach repo. Więc kiedy przejdę do terminala i uruchomię git status, pokaże mi to:

# On branch master
# Your branch and 'origin/master' have diverged,
# and have 2 and 4 different commits each, respectively.
#
# Changes not staged for commit:
# (use "git add/rm <file>..." to update what will be committed)
# (use "git checkout -- <file>..." to discard changes in working directory)
#
# deleted: Documents/m3/m3---Best-Game-Ever
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/CCLab_2/cclab_sketch_1/src/Boxes.cpp
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/CCLab_2/cclab_sketch_1/src/Boxes.h
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/ball_bouncing/Ball.cpp
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/ball_bouncing/Ball.h
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/bouncing_ball_classes/src/ball.cpp
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/bouncing_ball_classes/src/ball.h
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/ms_final/src/backGround.cpp
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/ms_final/src/backGround.h
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/ms_final/src/backGround2.cpp
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/ms_final/src/backGround2.h
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/mySketch/src/backGround.cpp
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/mySketch/src/backGround.h
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/mySketch/src/backGround2.cpp
# deleted: Documents/of_v0072_osx_release/apps/myApps/mySketch/src/backGround2.h
# deleted: README.md
#
# Untracked files:
# (use "git add <file>..." to include in what will be committed)
#
# .Trash/
# .bash_history
# .dropbox/
# .openmdao/
# .ssh/
# Documents/2nd_semester/
# Documents/Arduino/
# Documents/OpenMDAO/
# Documents/Personal/
# Documents/T.A/
# Documents/gitHub/
# Documents/mySite/
# Documents/openFrameworks/
# Documents/resources/
# Documents/webcam-pulse-detector-master/
# Dropbox/
# Library/
# Music/
no changes added to commit (use "git add" and/or "git commit -a")

Nie trzeba dodawać, że nigdy nie jestem w stanie nic wyciągnąć. Mówi, że wszystko jest aktualne. W pewnym momencie miałem repo, które przesyłało te foldery bez plików do gitHub, ale usunąłem to.

Jakieś sugestie?